באתרי הייצור והלוגיסטיקה של הקבוצה נעשה שימוש בחומרים שונים, המוגדרים כחומרים מסוכנים. לשם הפעלת מערכות הקירור של אתרי הקבוצה נעשה שימוש באמוניה, שהינו גז רעיל. תחום הקירור באמוניה כפוף לרגולציה של מספר משרדים ממשלתיים וגופים מקצועיים. הקבוצה משקיעה משאבים ניכרים למזעור הסיכון הנובע ממערכות הקירור באמוניה באתריה בהתאם לרגולציה המחמירה, ואף מעבר לה, כאשר מיושמת באתרים מדיניות המנכ"ל לצמצום כמויות האמוניה ומעבר לקררים חלופיים.
כאמור, אנחנו פועלים ללא לאות לאתר דרכים להפחתת כמות האמוניה. כלל אתרי תנובה מגבשים תכנית רב שנתית ארוכת טווח למעבר הדרגתי מאמוניה לקירור חלופי שאינו רעיל (כגון CO2, פרופילן גליקול או HFO).
פרויקטים למעבר קירור מאמוניה לקררים חלופיים עומדים להתבצע במרלו"ג צפון, כמו-גם במחלבות רחובות וטנא נגה.